! When using this topology, make sure you've included the required parameters ! (see http://swisssidechain.ch/MD/charmm.html) RESI DADMM 0.00 ! Adamanthane GROUP ATOM N NH1 -0.4700 ATOM HN H 0.3100 ATOM CA CT1 0.0700 ATOM HA HB 0.0900 GROUP ATOM CB CT2 -0.1800 ATOM HB1 HA 0.0900 ATOM HB2 HA 0.0900 GROUP ATOM CG CT0 0.0000 GROUP ATOM CD1 CT2 -0.1800 ATOM HD11 HA 0.0900 ATOM HD12 HA 0.0900 GROUP ATOM CD2 CT2 -0.1800 ATOM HD21 HA 0.0900 ATOM HD22 HA 0.0900 GROUP ATOM CD3 CT2 -0.1800 ATOM HD31 HA 0.0900 ATOM HD32 HA 0.0900 GROUP ATOM CE1 CT1 -0.0900 ATOM HE1 HA 0.0900 GROUP ATOM CE2 CT1 -0.0900 ATOM HE2 HA 0.0900 GROUP ATOM CE3 CT1 -0.0900 ATOM HE3 HA 0.0900 GROUP ATOM CZ1 CT2 -0.1800 ATOM HZ11 HA 0.0900 ATOM HZ12 HA 0.0900 GROUP ATOM CZ3 CT2 -0.1800 ATOM HZ31 HA 0.0900 ATOM HZ32 HA 0.0900 GROUP ATOM CZ2 CT2 -0.1800 ATOM HZ21 HA 0.0900 ATOM HZ22 HA 0.0900 GROUP ATOM C C 0.5100 ATOM O O -0.5100 BOND CB CA N HN N CA C CA C +N CA HA DOUBLE O C BOND CG CB BOND HB1 CB BOND HB2 CB BOND CE1 CD1 BOND CG CD1 BOND CE2 CD2 BOND CG CD2 BOND CE3 CD3 BOND CG CD3 BOND CZ1 CE1 BOND CZ3 CE1 BOND CZ1 CE2 BOND CZ2 CE2 BOND CZ2 CE3 BOND CZ3 CE3 BOND CD1 HD11 BOND CD1 HD12 BOND CD2 HD21 BOND CD2 HD22 BOND CD3 HD31 BOND CD3 HD32 BOND CE1 HE1 BOND CE2 HE2 BOND CE3 HE3 BOND CZ1 HZ11 BOND CZ1 HZ12 BOND CZ2 HZ21 BOND CZ2 HZ22 BOND CZ3 HZ31 BOND CZ3 HZ32 IMPR N -C CA HN C CA +N O IC -C CA *N HN 1.3551 126.4900 180.0000 115.4200 0.9996 IC -C N CA C 1.3551 126.4900 180.0000 114.4400 1.5390 IC N CA C +N 1.4592 114.4400 180.0000 116.8400 1.3558 IC +N CA *C O 1.3558 116.8400 180.0000 122.5200 1.2297 IC CA C +N +CA 1.5390 116.8400 180.0000 126.7700 1.4613 IC N C *CA CB 1.4592 114.4400 -123.23 111.0900 1.5461 IC N C *CA HA 1.4592 114.4400 120.45 106.3900 1.0840 IC N CA CB CG 1.46 112.19 -171.20 118.87 1.58 IC N CA CB HB1 1.46 112.19 -49.26 106.41 1.09 IC N CA CB HB2 1.46 112.19 64.29 108.47 1.09 IC CA CB CG CD1 1.56 118.87 -69.26 112.31 1.58 IC CA CB CG CD2 1.56 118.87 172.02 108.72 1.58 IC CA CB CG CD3 1.56 118.87 53.00 112.44 1.58 IC CB CG CD1 CE1 1.58 112.31 -177.46 111.21 1.56 IC CB CG CD1 HD11 1.58 112.31 -57.24 109.02 1.09 IC CB CG CD1 HD12 1.58 112.31 62.03 109.17 1.09 IC CB CG CD2 CE2 1.58 108.72 179.65 111.38 1.56 IC CB CG CD2 HD21 1.58 108.72 -60.10 109.00 1.09 IC CB CG CD2 HD22 1.58 108.72 59.03 109.15 1.09 IC CB CG CD3 CE3 1.58 112.44 177.60 110.90 1.56 IC CB CG CD3 HD31 1.58 112.44 57.41 109.14 1.09 IC CB CG CD3 HD32 1.58 112.44 -61.96 109.22 1.09 IC CG CD1 CE1 CZ1 1.58 111.21 60.52 109.54 1.56 IC CG CD1 CE1 CZ3 1.58 111.21 -59.80 109.35 1.56 IC CG CD1 CE1 HE1 1.58 111.21 -179.59 109.40 1.09 IC CG CD2 CE2 CZ2 1.58 111.38 60.16 109.29 1.56 IC CG CD2 CE2 HE2 1.58 111.38 179.97 109.41 1.09 IC CG CD3 CE3 HE3 1.58 110.90 179.82 109.37 1.09 IC CD1 CE1 CZ1 HZ11 1.56 109.54 179.73 109.56 1.09 IC CD1 CE1 CZ1 HZ12 1.56 109.54 59.55 109.55 1.09 IC CD1 CE1 CZ3 HZ31 1.56 109.35 -179.94 109.49 1.09 IC CD1 CE1 CZ3 HZ32 1.56 109.35 -59.90 109.47 1.09 IC CD2 CE2 CZ2 HZ21 1.56 109.29 60.21 109.52 1.09 IC CD2 CE2 CZ2 HZ22 1.56 109.29 -179.68 109.52 1.09 IC CB N *CA C 0.00 0.00 -120 0.00 0.00 IC CG CA *CB HB1 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC CG CA *CB HB2 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC CD3 CB *CG CD2 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC CD2 CB *CG CD1 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC CE1 CG *CD1 HD11 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC CE1 CG *CD1 HD12 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC CE2 CG *CD2 HD21 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC CE2 CG *CD2 HD22 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC CE3 CG *CD3 HD31 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC CE3 CG *CD3 HD32 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC CZ1 CD1 *CE1 CZ3 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC CZ1 CD1 *CE1 HE1 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC CZ1 CD2 *CE2 CZ2 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC CZ1 CD2 *CE2 HE2 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC CZ2 CD3 *CE3 HE3 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC CE2 CE1 *CZ1 HZ11 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC CE2 CE1 *CZ1 HZ12 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC CE3 CE2 *CZ2 HZ21 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC CE3 CE2 *CZ2 HZ22 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC CE3 CE1 *CZ3 HZ31 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC CE3 CE1 *CZ3 HZ32 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00