! When using this topology, make sure you've included the required parameters ! (see http://swisssidechain.ch/MD/charmm.html) RESI DOAS 0.00 ! o-acetylserine GROUP ATOM N NH1 -0.4700 ATOM HN H 0.3100 ATOM CA CT1 0.0700 ATOM HA HB 0.0900 GROUP ATOM CB CT2 0.1000 ATOM HB1 HA 0.0900 ATOM HB2 HA 0.0900 ATOM OG OCC -0.43 ATOM CD CC 0.66 ATOM OD O -0.5700 ATOM CE CT3 -0.21 ATOM HE3 HA 0.0900 ATOM HE1 HA 0.0900 ATOM HE2 HA 0.0900 GROUP ATOM C C 0.5100 ATOM O O -0.5100 BOND CB CA N HN N CA C CA C +N CA HA DOUBLE O C BOND OG CD BOND CE CD BOND OD CD BOND HE3 CE BOND HE1 CE BOND HE2 CE BOND OG CB BOND HB1 CB BOND HB2 CB IMPR N -C CA HN C CA +N O IMPR CD OG OD CE CMAP -C N CA C N CA C +N IC -C CA *N HN 1.3551 126.4900 180.0000 115.4200 0.9996 IC -C N CA C 1.3551 126.4900 180.0000 114.4400 1.5390 IC N CA C +N 1.4592 114.4400 180.0000 116.8400 1.3558 IC +N CA *C O 1.3558 116.8400 180.0000 122.5200 1.2297 IC CA C +N +CA 1.5390 116.8400 180.0000 126.7700 1.4613 IC N C *CA CB 1.4592 114.4400 -123.23 111.0900 1.5461 IC N C *CA HA 1.4592 114.4400 120.45 106.3900 1.0840 IC N CA CB OG 1.47 109.47 -59.94 109.56 1.45 IC N CA CB HB1 1.47 109.47 -179.97 109.46 1.09 IC N CA CB HB2 1.47 109.47 60.11 109.44 1.09 IC CA CB OG CD 1.53 109.56 179.99 120.09 1.34 IC CB OG CD CE 1.45 120.09 -179.99 120.12 1.51 IC CB OG CD OD 1.45 120.09 -0.02 119.97 1.21 IC OG CD CE HE1 1.34 120.12 -179.94 109.64 1.09 IC OG CD CE HE2 1.34 120.12 -59.91 109.49 1.09 IC OG CD CE HE3 1.34 120.12 59.91 109.47 1.09 IC CB N *CA C 0.00 0.00 -120 0.00 0.00 IC OG CA *CB HB1 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC OG CA *CB HB2 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00 IC OD OG *CD CE 0.00 0.00 180.00 0.00 0.00 IC HE3 CD *CE HE1 0.00 0.00 120.00 0.00 0.00 IC HE3 CD *CE HE2 0.00 0.00 -120.00 0.00 0.00